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中科院青島能源所突破益生菌質檢關鍵技術

發布時間:2023/6/21 10:19:22編輯:Ma Liang
已有5919人關注

據悉,中國科學院青島生物能源與過程研究所(以下簡稱“中科院青島能源所”)聯合中國食品發酵工業研究院等,開發了基于拉曼組原理的益生菌單細胞質檢技術SCIVVS,為快速、準確、全面、低成本的益生菌產品質檢提供了全新的解決方案。相關成果近日發表于iMeta雜志。

長期以來,益生菌質檢大多依賴于分離培養或元基因組測序,存在耗時長、成本高、復合益生菌產品深度質檢困難等瓶頸。針對這一瓶頸,中科院青島能源所單細胞中心聯合中國食品發酵工業研究院、青島東海藥業和青島星賽生物等團隊,基于拉曼組原理,開發了一種名為SCIVVS的單細胞精度益生菌質檢技術。
針對益生菌產品,SCIVVS提取所有細胞進行重水飼喂和單細胞拉曼光譜的高通量采集。在每一張拉曼光譜上,利用其指紋區,基于與益生菌單細胞拉曼光譜參照數據庫的比對,快速完成每個細胞的種類鑒定環節。通過構建21種法定可食用益生菌的標準菌株拉曼光譜數據庫,SCIVVS可實現平均高達93%的分辨準確度。同時,利用其重水利用峰(C-D峰),則可針對每個物種,量化每個細胞的活性、代謝活力等。進而可通過拉曼激活單細胞分選技術,快速獲得目標種類或目標代謝活力的單細胞,從而對接下游單細胞全基因組測序或培養。

為了支撐SCIVVS,中科院青島能源所和青島星賽生物合作,成功研制單細胞拉曼光鑷分選儀、高通量流式拉曼分選儀。運用單細胞拉曼光鑷分選儀,研究人員直接從純種或復合益生菌產品出發,在5個小時之內,完成了精確到每個物種的活細胞計數、活力定量和活力異質性測量。同時,針對乳酸桿菌、雙歧桿菌或鏈球菌等各種益生菌,均能產出高質量的單細胞基因組(覆蓋度可高達99.4%),從而完成精準溯源。

對比目前的益生菌產品質檢方法,SCIVVS具有快速、準確、全面、低成本、易于自動化等優勢,較傳統方法快20倍以上,而成本僅為傳統方法的1/10,且能免培養、高精度、自動化、一站式地完成產品中每個物種的活細胞計數、活力定量、活力異質性測量和溯源,有望形成新的技術標準。

微信號:ayiwangapp17

(來源: 科技日報 )

標簽:拉曼光譜儀,基因測序儀

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